我中心作物基因組編輯研發團隊研發新型堿基編輯器

    近日，我中心玉米DNA指紋及分子育種北京市重點實驗室作物基因組編輯研發團隊創新研發了兩個水稻新型堿基編輯器，并在國際知名學術期刊Frontiers in Genetics（IF=4.15）上在線發表“Increasing cytosine base editing scope and efficiency with engineered Cas9-PmCDA1 fusions and the modified sgRNA in rice”。

    該研究利用SpCas9n（D10A）及SpCas9的變體VQRn（D10A），研發了基于胞苷脫氨酶PmCDA1的新型堿基編輯器，實現了對PAM為NAG及NGA靶點的C至T堿基替換，并顯示出與常用的rAPOBEC1編輯器不同的堿基編輯窗口。結構優化的sgRNA可以提升堿基編輯效率最高達7.6倍。該研究成功實現了對水稻兩個重要基因OsWaxy和OsALS上多個靶位點的堿基編輯，拓展了堿基編輯器的應用范圍，提升了該系統在農作物基因組編輯中的應用潛力。

     武瑩為本文第一作者，楊進孝博士和張成偉博士為本文共同通訊作者。本研究得到了北京學者項目資助。作物基因組編輯研發團隊是2017年玉米研究中心引進建設的技術創新團隊，目前主要聚焦于堿基編輯、精確替換、組學編輯技術及其在作物中的高效應用。這篇文章是作物基因組編輯研發團隊組建后公開發表的第一項研究成果。